大连理工大学系统工程研究所成立于1978年，是教育部首批批准的系统工程专门研究机构之一，是一个以系统工程学科为核心的交叉综合学科群体。经过30多年的发展，已经成为管理科学与工程学科领域的国家重点建设学科之一，也是辽宁省重点建设学科之一。目前拥有1个博士后流动站、l个一级学科博士点、2个硕士点。
系统工程研究所目前拥有一支以中国工程院院士王众托教授为核心的老中青相结合的研究队伍，该队伍具有国家自然科学基金委创新研究群体、教育部创新团队称号，研究领域主要包括数据科学与知识管理、电子商务与物流管理、复杂系统、管理科学等：先后承担并完成了60多项国家自然科学基金项目（其中重点以上项目7项）、7项“863”项目和国家“攻关”项目、14项博土点基金项目和国家教委基金项目、以及数十项省市和大中型企业委托的项目，获得国家科技进步奖2项、省部级科技进步奖12项。研究成果的应用部门包括国家自然科学基金委员会、辽宁省科技厅、大连市相关政府部门和企事业单位等。
系统工程研究所拥有国家“211工程”重点学科及辽宁省重点学科投资建设的“系统分析与经营管理信息化”实验室、“群决策与系统集成”实验室，以及与HP-Compaq公司共同投资1000万元建立的电子商务实验室。
